Si no queremos el soporte IPv6 en el kernel deberemos hacer lo siguiente:
echo net.ipv6.conf.all.disable_ipv6=1 > /etc/sysctl.d/disableipv6.conf
Tan sólo queda reiniciar para que no se carguen los módulos de IPv6.
Fuente: http://wiki.debian.org/DebianIPv6#How_to_turn_off_IPv6